J Comput Biol: Ný aðferð til að spá fyrir um markmið gegn veirueyðandi lyfjum eða bóluefni

Ný aðferð til að spá fyrir um efnilegustu veirueyðandi lyfin eða markmið bóluefnisins er byggð á þeim breytingum sem gerðar hafa verið af veiru glýkópróteinum við viðurkenningu og bindingu við hýsilfrumur. Þessi spáaðferð miðar að aðalkeðju vetnistengi hæsta frjálsa orku mótífsins. Skyldar rannsóknarniðurstöður eru birtar í Journal of Computational Biology, sem er ritrýnd tímarit sem gefin var út af Mary Ann Liebert.

Robert Penner er formaður Rene Thom hjá frönsku stofnuninni fyrir háskólanám (Bures-sur-Yvette) og UCLA stærðfræðilíffræði. Hann er höfundur þessarar greinar sem ber yfirskriftina" Backbone Free Energy Estimator beitt á veiru glýkópróteinum"

Uppruni myndar: Mary Ann Liebert, Inc., útgefendur

Þegar veiran fer inn í hýsilfrumuna og frásogast, gengur veiran yfirleitt í kröftugri samsöfnun og myndar samruna / síast mótíf. Penner lagði til almenna aðferð til að spá fyrir um mjög líklega virkar leifar úr þrívíddarbyggingu veiru glýkópróteina. Aðferðin felur í sér að greina vetnistengi próteinsins og reikna út frjálsan orkumun á samsvarandi eiginleikum til að ákvarða svæðin þar sem líklegast er að sköpunarbreytingin eigi sér stað. Aðferðin sem lögð er til í þessari grein er nú notuð til að toppa glýkóprótein af SARS CoV-2, sem getur valdið COVID-19.

Misha Gromov frá Institute of Advanced Science og New York University sagði:" Stærðfræðileg hugmynd leiðir beint til hagnýtrar merkingar, sem er einfaldlega kraftaverk, en umbunin er mikil vegna þess að hún kemur fram í Maxwell' s rafsegulsviðskenning - það færir útvarp og sjónvarp, opnar dyrnar að fræðilegum útreikningum í stafrænum heimi okkar." Hann er frægur stærðfræðingur og Abel verðlaunahafi (einnig þekkt sem Nóbelsverðlaunin í stærðfræði)." Aðeins þegar höfundur þess er frægur stærðfræðingur en hefur einnig breiðan vísindalegan sjónarmið, er slík hugmynd möguleg, og þetta er sjaldgæft meðal bestu stærðfræðinga okkar tíma. Robert Penner er svo sjaldgæfur stærðfræðingur að hann fann að aðferðin við próteinbyggingarmynstur er frábrugðin öðrum í heiminum og próteinbyggingarmynstrið er afleiðing hreinnar stærðfræðilegrar hugsunar. Þessi aðferð mun líklega gegna hlutverki og flýta fyrir þróun vírusvarnarlyfja eða bóluefna. En aðeins tilraunir geta sannað þetta." (Bioon.com)

heimild: